Svarbiausi baltymų sintezės komponentai Neringa Jucevičiūtė, MF14/1

Svarbiausi baltymų sintezės komponentai: a) ribosomos: sudėtis, struktūra, funkcijos. b) tRNR: struktūra ir funkcijos baltymų sintezės procese. c) aminoacil–tRNR sintetazės (ARS-azės) ir jų charakteristika. Aminorūgščių aktyvinimas.

Ribosomų sandara

Ribosomų centrai Aminoacilinis (A) Peptidilinis (P) Išėjimo (E)

Branduolėlyje rRNR jungiasi su ribosominiais baltymais pre-rRNR 5S - rRNR Branduolėlyje rRNR jungiasi su ribosominiais baltymais RPL, large subunit ribosomal protein; RPS, small subunit ribosomal protein.

Ribosomų sandara rRNR Baltymai 65% (prokariotuose) Funkcija: Karkasas jungtis baltymams Būdingos fermentų savybės 35% (prokariotuose) Funkcija: Struktūrinė Fermentai Daugelio funkcija nežinoma Ribosomų struktūrai palaikyti labai svarbūs Mg2+ - mažėjant koncentracijai subvienetai disocijuoja.

tRNR sintezė Branduolyje, veikia RNR pol III Pirminis transkriptas modifikuojamas: Modifikuojamos bazės Introno splaisingas Ψ

tRNR antrinė ir tretinė struktūros Tretinė struktūra – erdvėje išsidėsto spiraliniai ir nespiraliniai fragmentai Antrinė struktūra –tRNR spiraliniai frgamentai

Antrinė tRNR struktūra Lemia vandeniliniai ryšiai Nesuporuotos bazių grupės: D kilpa Aminoacil sintetazė atpažįsta tRNR Antikodono kilpa 5’- pirimidinas - pirimidinas - X-Y-Z - modifikuotas purinas - kintanti bazė - 3’ Papildoma kilpa TΨC kilpa Aminoacil – tRNR jungiasi su ribosoma CCA 3’ galas GU wobbling Akceptorinis stiebas TΨC stiebas UH2 stiebas Antikodono stiebas

tRNR perneša aminorūgštį į ribosomą

Nevienareikšmis atitikimas (wobbling) 61 kodonui transliuoti reikia mažiausiai 32 tRNR

Aminoacil tRNR sintetazė 3 prisijungimo centrai: Aminorūgšties tRNR ATP Aktyvumui būtini Mg2+ : His imidazolo žiedas prijungia ATP Sintetazių yra 20 tipų, joms būdinga: Absoliutus specifiškumas – 1 aminorūgštį atitinka tik vienas fermentas Vienas fermentas specifiškas kelioms tRNR

Aminorūgščių aktyvinimas Aminorūgštis + ATP → Aminoacil-AMP (aminoaciladenilatas) + PPi Aminoacil-AMP + tRNR → Aminoacil-tRNR + AMP

1.Aminoacilinė grupė pernešama prie 2’-OH grupės Aminoacilinė grupė iškart pernešama prie 3’-OH grupės 2. Aminoacilinė grupė pernešama prie 3’-OH grupės

Literatūros sąrašas Praškevičius A, Ivanovienė L. Biochemija. Kaunas: Vitae Litera; 2006: 100-102, 524-529, 532-536 Rodwell V, Bender D, Botham K, Kennelly P, Weil P. Harper's Illustrated Biochemistry. 28th ed. The McGraw-Hill Education; 2009: 355-356, 362-363