... Why Just NMR? – Because there is hardly another technique that is so informative for many different types of applications, and because there is no.

Slides:

Advertisements

Similar presentations

NMR: Theory and Equivalence. Nuclear Magnetic Resonance Powerful analysis – Identity – Purity No authentic needed Analyze nuclei – 1 H, 13 C, 31 P, etc.

Advertisements

A) 80 b) 53 c) 13 d) x 2 = : 10 = 3, x 3 = 309.

2DNMR. Coupling Constants Geminal Coupling are usually negative: CH 2 Vicinal coupling usually positive: CH-CH Why? Coupling is through bonding electrons;

4 aromatic protons Can we use 2D to assign this spectrum? Structure first determined by Woodward in 1948 (without NMR!)

J Nat. Prod. 2006, 69, Cytotoxic Xenia Diterpenoids from the Soft Coral Xenia umbellata Ali A. El-Gamal, Shang-Kwei Wang and Chang-Yih Duh Department.

TopSpin Training Course, 22nd November 2006

Supplemental Information

Solving Unknown Structures Using NMR Organic Structure Analysis, Crews, Rodriguez and Jaspars.

How to Analyze of 2D NMR Spectra ( small molecules) 노 정 래.

Structural Elucidation of a Diterpene Derivative from Stemodia Maritima Eugene E. Kwan and William F. Reynolds April 2003.

Assignments of Hydrogen and Carbon Atoms of Artemisinin

13.3 Introduction to 1 H NMR Spectroscopy. 1 H and 13 C both have spin = ±1/2 1 H is 99% at natural abundance 13 C is 1.1% at natural abundance The nuclei.

J. Nat. Prod. 2004, 67, New Nardosinanes and 19-Oxygenated Ergosterols from the Soft Coral Nephthea armata Collected in Taiwan Ali A. H. El-Gamal,

The most important instrumental technique used by organic chemists to determine the structure of organic compounds. NMR spectroscopy helps to identify.

ΜΕΤΑΣΥΛΛΕΚΤΙΚΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ 3. Μετασυλλεκτική Εργ3-Λιοσάτου Γ.2 ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΕΠΗΡΕΑΖΟΥΝ ΤΗ ΦΘΟΡΑ ΤΩΝ ΟΠΩΡΟΚΗΠΕΥΤΙΚΩΝ Αναπνοή Η λειτουργία.

Single-Scan Multidimensional NMR Spectroscopy

Chem. 133 – 4/18 Lecture.

Nuclear Magnetic Resonance

Supporting Information

Hľadanie motívov v reťazcoch DNA

NMR: Theory and Equivalence

INTRANSNET Contract No. G7RT-CT

Phytochemical investigation of Eriosema laurentii

Example Bullet Point Slide

Agropotravinárske biotechnológie Green Biotech

Supporting Information for

Geografický informačný systém

INTERNATIONAL TRADE AND FORWARDING AGENTS

RIZIKÁ PRI REALIZOVANÍ PROJEKTU

Vývoj a druhy počítačov

Barbora Ondíková VII.D 2014/2015

TUKE – asociovaný člen v CERN-e

Využitie IKT na hodinách anglického jazyka

Vlastnosti kvantitatívnych dát

Dvojrozmerné polia Kód ITMS projektu:

Lokálne príznaky vo farebných obrazoch

PRACOVNÉ PROSTREDIE PRI PRÁCI S POČÍTAČMI Z HĽADISKA ERGONÓMIE

Fyzikálna chémia,1.ročník, HF Technická univerzita v Košiciach

Servio as a Service Service desk z Telekom cloudu

Referuje: MUDr. Slávik Pavol ÚPA JLF UK a UNM Martin

Solvent Suppression (Claridge 12.5)

Heuristické optimalizačné procesy

Alternatívny rock Tatiana Bučková III.D.

Veľkosť trhu agentúrnych zamestnancov

De Bonových 6 klobúkov myslenia

اثرات گرمايش جهاني تغييرات آب و هوا، تأثيرات عميق و شديدي بر بسياري از عوامل اساسي موثر بر سلامت از جمله : آب، غذا، هوا و محيط زيست دارد كه اين مورد خود.

Seminár č. 9 - osnova Metódy sieťového plánovania a riadenia:

Elucidating Structures

Dejiny biológie.

Martina Kubovčíková, OFMJ 1. Fkl ( )

Interaktívna kniha a e-learningový systém pre deti - Opera nehryzie

Prevencia drogových závislostí v školskej praxi

Neformálne ekonomické fórum 3. marec 2011

Využitie biomasy v environmentálnych biotechnológiách

SAMPLE SUBMISSION FORM

TVORBA VIET A OTÁZOK a KRÁTKYCH ODPOVEDÍ

Podpora adaptívneho WEB-u prostriedkami strojového učenia

··,--.,.,. ·.._. ·.., ' t... ' ' ;'I.1!; " ·( '·( ' ·), '+ "."

Journal of Antibiotics

Solving Unknown Structures Using NMR

OH C13 (ppm) H1 (ppm) Atom number

-.&- ·Af& Q 0 "i'/

Structure determination by NMR

Nuclear Magnetic Resonance (NMR)

Introduction to NMR Spectroscopy

Nuclear Magnetic Resonance (NMR)

Introduction to NMR Spectroscopy

NMR Spectra of YS1-HP2627 Collected at 25°C on a Varian VNMRS 800 Instrument.(A) HSQC spectrum. NMR Spectra of YS1-HP2627 Collected at 25°C on a Varian.

Introduction to NMR Spectroscopy

Presentation transcript:

... Why Just NMR? – Because there is hardly another technique that is so informative for many different types of applications, and because there is no other technique that provides so much fun. Richard R. Ernst: Nobelova cena 1991: FT NMR

Mária Vilkováa, Ján Imricha, Miroslav Repčákb, Veronika Porackáb STRATÉGIA HĽADANIA ŠTRUKTÚRY NEZNÁMEJ ZLÚČENINY POMOCOU NMR - príklad rastlinných metabolitov. Mária Vilkováa, Ján Imricha, Miroslav Repčákb, Veronika Porackáb aLaboratórium NMR spektroskopie, Ústav chémie, Prírodovedecká fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Moyzesova 11, 040 01 Košice bKatedra botaniky, Ústav biologických a ekologických vied, Prírodovedecká fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Moyzesova 11, 040 01 Košice

NMR spektroskopia Varian VNMRS 600 NMR spektrometer: gradientová sonda PFG OneNMR (dutina 5 mm) 1H NMR (599.877 MHz), 13C NMR (150.855 MHz) interný štandard: tetrametylsilán (TMS, 0 ppm) deuterované rozpúšťadla: metanol (CD3OD) alebo dimetylsulfoxid (DMSO) chemické posuny -  stupnica [ppm] interakčné konštanty - J [Hz] protón-protón a protón-uhlík korelácie - gradientové selektívne homonukleárne a heteronukleárne experimenty s adiabatickými pulzmi Rastliny boli vypestované v botanickej záhrade Ústavu biológie a ekológie PF UPJŠ. Rastliny boli spracované a metanolový extrakt bol rozdelený semipreparatívnou HPLC. Odparky jednotlivých frakcií boli následne analyzované pomocou NMR spektroskopie na spektrometri VNMRS 600. Sonda OneNMR. Vzorka v NMR kyvete v rotore (vpravo). VNMRS 600 NMR spektrometer (vpredu konzola a RF inteface, vzadu magnet). Prierez magnetom.

1H a 13C NMR spektrum VZORKA 1: zmes rastlinných metabolitov Obrázok 1. 1H NMR (600 MHz, CD3OD) spektrum (8,50 – 3,00 ppm) zmesi metabolitov. Obrázok 2. 13C NMR (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) zmesi metabolitov.

1H a 13C NMR spektrum VZORKA 1: zmes rastlinných metabolitov Obrázok 2. 13C NMR (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) vzorky 1. Obrázok 1. 1H NMR (600 MHz, CD3OD) spektrum (8,50 – 3,00 ppm) vzorky 1. Obrázok 3. Spektrum DEPT (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) vzorky 1.

[13C,1H]-HSQC (1H) (13C) [ppm] [ppm] 8.02 141.1 7.86 146.1 8.02 141.1 7.86 146.1 7.67 132.7 7.55 129.9 7.24 138.3 7.22 114.4 7.08 119.6 6.85 102.7 6.79 102.5 6.64 109.9 6.56 108.6 6.40 116.5 6.29 114.6 5.84 119.3 Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesi metabolitov (vpravo oblasť aromatických protónov a uhlíkov).

[13C,1H]-HSQC (1H) (13C) [ppm] [ppm] 4.96 102.5 4.94 103.6 4.96 102.5 4.94 103.6 4.91 102.8 Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesi metabolitov (vpravo oblasť anomérnych protónov a uhlíkov).

[13C,1H]-HSQC (1H) (13C) [ppm] [ppm] 3.90 62.6 3.69 62.5 62.4 3.90 62.6 3.69 62.5 62.4 3.82 56.0 3.80 55.9 3.56 74.9 3.48 78.5 78.1 3.43 71.4 71.2 Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesi metabolitov (vpravo oblasť protónov a uhlíkov patriacich cukorným zložkám).

[1H,1H]-COSY Obrázok 5. COSY spektrum (CD3OD, 8,50 – 3,00 ppm) zmesi metabolitov (vpravo oblasť aromatických protónov a protónov na násobných väzbách).

[13C,1H]-HMBC 163.1 7.67 (132.7) 158.2 138.3 7.24 (138.8) 158.2 132.7 6.79 (102.5) 158.2 119.1 108.6 6.56 (108.6) 119.1 102.5 5.84 (119.3) 171.0 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 163.1 7.67 (132.7) 158.2 138.3 (7.24) 7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67) 6.79 (102.5) 158.2 119.1 108.6 (6.56) 6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79) 5.84 (119.3) 171.0 (C=O) Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 163.1 7.67 (132.7) 158.2 138.3 (7.24) 7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67) 6.79 (102.5) 158.2 119.1 108.6 (6.56) 6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79) 5.84 (119.3) 171.0 (C=O) Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 163.1 7.67 (132.7) 158.2 138.3 (7.24) 7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67) 6.79 (102.5) 158.2 119.1 108.6 (6.56) 6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79) 5.84 (119.3) 171.0 (C=O) Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.

[13C,1H]-HMBC 171.9 8.02 (141.1) 159.0 129.9 117.0 164.0 7.55 (132.7) 159.0 141.1 164.3 6.85 (102.7) 159.0 118.1 109.9 6.64 (109.9) 118.1 102.7 6.40 (116.5) 171.9 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 162.8 7.86 (146.1) 144.4 119.6 116.5 (sl.) 149.7 7.22 (114.4) 135.9 116.5 7.08 (119.6) 146.1 144.4 6.29 (114.6) 162.8 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 162.8 7.86 (146.1) 144.4 119.6 116.5 (sl.) 149.7 7.22 (114.4) 135.9 116.5 7.08 (119.6) 146.1 144.4 6.29 (114.6) 162.8 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 162.8 7.86 (146.1) 144.4 119.6 116.5 (sl.) 149.7 7.22 (114.4) 135.9 116.5 7.08 (119.6) 146.1 144.4 6.29 (114.6) 162.8 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).

[13C,1H]-HMBC 162.8 7.86 (146.1) 144.4 119.6 116.5 (sl.) 149.7 7.22 (114.4) 135.9 116.5 7.08 (119.6) 146.1 144.4 6.29 (114.6) 162.8 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.

[13C,1H]-HMBC Anomérne protóny 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.91 (102.8) 149.7 Metylové skupiny 3.80 (56.0) 164.3 3.71 (56.2) 163.1 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.

[13C,1H]-HMBC Anomérne protóny 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.91 (102.8) 149.7 Metylové skupiny 3.80 (56.0) 164.3 3.71 (56.2) 163.1 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.

[13C,1H]-HMBC Anomérne protóny 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.91 (102.8) 149.7 Metylové skupiny 3.80 (56.0) 164.3 3.71 (56.2) 163.1 Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.

[13C,1H]-HMBC Anomérne protóny 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.2 4.91 (102.8) 149.7 Metylové skupiny 3.80 (56.0) 164.3 3.71 (56.2) 163.1

POĎAKOVANIE Doc. RNDr. Ján Imrich, CSc. Ing. Jan Pelnař, CSc. Mgr. Branislav Horváth, PhD. RNDr. Marianna Prokaiová Prof. RNDr. Miroslav Repčák, DrSc. RNDr. Veronika Poracká

ĎAKUJEM ZA POZORNOSŤ!