1. Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.

2. Ревертаза. РНК-зависимая ДНК- полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице.

3. Мобильные Ретроэлементы эукариот LTR-содержащие Ретротранспозоны Ретровирусы экзогенные эндогенные не LTR-содержащие LINE ( long interspersed elements) SINE ( short interspersed elements)

4. Не LTR-содержащие

5. LINE (long interspersed elements) Структура мРНК  кодирующие  характерна усечённость копий с 5’-конца  нумерация нуклеотидов в последовательности LINE принято вести с 3’-конца и выражать в отрицательных числах

6. Схема жизненного цикла L1.

7. TPRT – реакция. (target-primed reverse transcription)  в ДНК-мишень вносится одноцепочечный разрыв  3’-конец одной из цепей используется в качестве затравки для синтеза кДНК  разрезание второй цепи ДНК-мишени [там же]  далее in vivo происходит: лигирование цепей ДНК разрушение РНК в составе гетеродуплекса репаративный синтез второй цепи ДНК

9. SINE (short interspersed elements)  не содержат кодирующих последовательностей  при транспозициях используют обратную транскриптазу из других источников  в качестве таких «доноров» выступают LINE  заканчивается олиго(А)-трактом  гомогенны по длине внутри одного семейства  не содержат 5’-концевых делеций  нумерацию нуклеотидов ведут с 5’-конца

10. Происхождение.  Из 7SL РНК с внутренней делецией - B1 грызунов, Alu приматов.  “tRNA-derived SINE” - в 5’-части есть высокая гомология с последовательностями определённых тРНК - В2 грызунов, TS табака, MIR всех млекопитающих. В то же время их 3’-концевой домен является АТ-богатым и происходит, по-видимому, из 3’-конца LINE-элементов.  Известны случаи происхождения SINE из генов малых ядерных РНК - Bm1 B. mori – из U1.  SINE-R из генома человека обязан своим происхождением длинному концевому повтору эндогенного ретровируса семейства HERV-K

11. LTR-содержащие

12. Структура LTR-содержащих элементов на примере ретровирусов.

13. Механизм обратной транскрипции.

14. Возможная эволюция LTR-ретротранспозоны Ретровирусы Эндогенные ретровирусы