1. RM110 1 1 1 1 WD-97 WD-101 WD-102 WD-124 a IIIh-H : RM110 (2.1) Hainan c agGY Ia-1 (2) Anhui agGY Ia-2 (3) agGY Ia-1 2 2 WD-2 WD-8 WD-36 agGY Ia-2 3 3 a Ia-H : agGY Ih-1 (2) Hainan agGYIh-1 2 2 WD-2 WD-19 WD-47 a Ih-H : RM216 (10.2) Anhui RM216 1 1 1 WD-57 WD-69 WD-77 a IIa-H : a RM3395 (8.2) Hainan RM3395 1 1 1 1 WD-59 WD-65 WD-80 WD-83 WD-87 WD-92 a IIh-H : Anhui RM20A (12.1) RM276 (6.3) RM20A WD-101 RM276 WD-131 1 WD-102 WD-109 WD-110 WD-111 WD-115 1 1 1 1 1 1 WD-119 WD-120 WD-122 WD-125 WD-129 WD-130 1 1 1 1 1 1 WD-103 b IIIa-H : WD-129 RM452 (2.3) Hainan RM452 WD-101 WD-102 WD-108 WD-120 WD-122 WD-125 1 1 1 1 WD-103 b IIIh-H : WD-16 agPHI h-1 WD-17 WD-19 WD-21 WD-25 WD-30 2 2 WD-32 WD-33 WD-34 WD-48 2 2 2 2 WD-18 b Ih-H : Hainan agPH Ih-1 (2) agPH Ia-1 RM2615 WD-3 WD-5 WD-8 WD-10 WD-12 WD-13 2 2 2 1 WD-14 WD-17 WD-18 WD-20 WD-21 WD-22 2 2 1 1 WD-24 WD-27 WD-29 WD-30 WD-31 WD-32 2 1 1 1 WD-33 WD-34 WD-35 WD-36 WD-38 WD-39 2 2 2 2 2 WD-41 WD-42 WD-43 WD-44 2 2 2 21 WD-7 WD-46 WD-47 WD-49 WD-50 WD-53 2 1 b Ia-H : Anhui agPH Ia-1 (2) RM2615 (6.2) b RM424 (2.4) Hainan WD-98 WD-106 WD-117 WD-118 WD-121 1 1 1 1 1 1 WD-113 b IIIh-L : RM424 agPH IIIa-1 3 3 3 3 WD-95 WD-98 WD-123 WD-106 b IIIa-L : Anhui agPH IIIa-1 (3) WD-92 c IIh-L : RM216 1 1 1 1 1 WD-57 WD-58 WD-61 WD-62 WD-63 WD-65 RM158 1 1 1 1 1 WD-69 WD-79 WD-80 WD-88 1 1 1 1 WD-59 RM158 (1.4) Hainan RM216 (10.2) Hainan RM2334 (3.7) WD-2 WD-12 WD-14 WD-21 WD-23 WD-27 RM2334 1 1 1 1 1 WD-28 WD-29 WD-30 WD-31 WD-33 WD-35 1 1 1 1 WD-39 WD-43 WD-48 1 1 1 WD-13 WD-52 c Ih-L : WD-21 WD-27 WD-45 WD-35 4 4 4 4 agHD Ia-1 c Ia-L : Anhui agHD Ia-1 (4) WD-58 WD-59 WD-64 WD-70 WD-78 WD-80 RM520 1 1 1 1 1 WD-83 1 WD-60 RM331 1 1 1 1 1 1 c IIh-H : RM520 (3.10) Hainan RM331 (8.3) agHD Ih-1 (2) Hainan agHD Ih-1 2 2 2 WD-6 WD-7 WD-18 WD-38 WD-47 WD-9 c Ih-H : Hainan agPN Ih-1 (2) WD-11 WD-13 agPN Ih-1 WD-46 2 2 2 d Ih-L : d RM2334 (3.7) Anhui RM244 (10.2) WD-2 WD-43 WD-49 RM2334 1 1 1 WD-47 RM244 1 1 d Ia-H : WD-92 WD-59 WD-67 WD-80 WD-86 WD-87 agPN IIh-1 4 4 4 4 4 4 WD-73 d IIh-H : agPN IIh-1 (4) Hainan

2. agSN Ia-1 (2) Anhui agSN Ia-1 2 2 2 2 2 2 WD-32 WD-34 WD-36 WD-38 WD-41 WD-42 e Ia-H : Hainan RM2459 (11.1) RM282 (3.6) RM282 1 1 1 RM2459 1 1 1 1 WD-68 WD-73 WD-86 WD-87 WD-93 e IIh-L : RM16 1 1 1 1 WD-57 WD-58 WD-61 WD-64 WD-66 WD-83 1 1 WD-91 WD-92 e IIh-H : RM16 (3.8) Hainan agSN Ih-1 (2) WD-11 WD-29 WD-34 WD-40 WD-45 WD-46 2 2 2 2 e Ih - H : agSN Ih-1 agSN IIIh-1 (4) Hainan agSN IIIh-1 (2) WD-101 WD-102 WD-103 WD-106 WD-111 WD-115 WD-116 WD-120 WD-123 2 2 4 4 4 4 4 2 2 4 4 4 WD-125 WD-127 WD-128 WD-130 2 2 2 4 4 e IIIh-H : agSN IIIh-1 agSN IIIh-2 e RM2334 (3.7) Anhui agSN IIIa-1 (2) RM110 (2.1) RM110 1 1 1 1 1 RM2334 1 1 1 1 WD-98 WD-101 WD-103 WD-107 WD-111 WD-115 11 1 1 WD-120 WD-127 WD-130 e IIIa-H : 2 2 2 2 2 agSN IIIa-1 RM488 1 1 1 1 (1.7) RM276 1 1 1 1 (6.3) RM282 (3.6) Anhui RM273 (4.5) WD-87 1 1 1 1 1 1 WD-67 WD-68 WD-72 WD-73 WD-76 1 1 1 1 1 e IIa-L : RM282 RM273 f Anhui RM258 (10.5) RM229 (11.5) WD-58 WD-67 WD-68 WD-72 WD-73 WD-76 WD-86 RM258 1 1 1 1 1 RM229 1 1 1 1 WD-88 1 f IIa-L : Hainan agGN IIh-1 (2) agGN IIh-1 2 2 2 WD-68 WD-73 WD-86 WD-93 f IIh-L : Anhui RM3307 (6.6) f Ia-L : WD-9 WD-10 WD-25 WD-43 RM3307 1 1 1 1 agGN Ia-1 (2) Anhui agGN Ia-1 2 2 2 2 WD-32 WD-34 WD-36 WD-42 f Ia-H : Hainan RM2334 (3.7) agGN Ih-1 (2) RM2334 2 12 12 1 12 WD-11 WD-21 WD-25 WD-29 WD-34 WD-40 1 1 WD-46 WD-45 f Ih-H : agGN Ih-1 agGN IIIh-1 (2) Hainan RM110 (2.1) RM110 1 1 1 1 1 WD-101 WD-102 WD-103 WD-106 WD-111 WD-115 WD-122 WD-125 2 2 2 2 f IIIh-H : agGN IIIh-1 RM2334 (3.7) Anhui RM110 (2.1) RM110 1 1 1 1 RM2334 1 1 1 1 WD-98 WD-103 WD-107 WD-111 WD-125 WD-130 f IIIa-H : RM20A 1 1 1 (12.1) g Hainan RM2334 (3.7) WD-101 WD-120 WD-123 WD-126 WD-127 WD-128 1 1 1 RM2334 1 WD-129 1 WD-130 g IIIh-L : WD-55 WD-57 WD-58 WD-59 WD-61 WD-64 WD-70 WD-73 WD-78 WD-79 WD-84 WD-85 WD-86 WD-88 1 1 1 1 1 1 RM258 g IIa-L : Anhui RM258 (10.5) WD-97 WD-118 WD-120 WD-121 WD-123 WD-127 1 1 1 RM20A 1 WD-130 1 1 1 RM8 1 g IIIa-L : Anhui RM8 (2.2) RM20A (12.1) RM2334 (3.7) Anhui agFT Ia-1 (2) RM2334 1 1 1 1 WD-2 WD-27 WD-46 WD-47 agFT Ia-1 2 2 2 g Ia-H : Hainan RM258 (10.5) RM213 (2.8) RM213 1 1 1 1 WD-61 WD-64 WD-73 WD-79 WD-85 WD-88 RM258 1 1 1 1 g IIh-L : 1 1 1 1 1 1 WD-21 WD-23 WD-25 WD-30 WD-31 WD-44 1 WD-46 WD-48 g Ih-H : RM2334 (3.7) Hainan 1 1 1 1 RM560 (7.5) 1 RM560 (7.5) Hainan WD-63 WD-87 1 1 RM560 g IIh-L :

3. h Hainan RM171 (10.6) WD-96 WD-98 WD-99 WD-100 WD-101 WD-103 WD-104 WD-106 WD-108 WD-111 WD-113 WD-115 WD-117 WD-118 WD-119 WD-120 WD-121 WD-122 WD-123 WD-125 WD-102 WD-127 WD-129 WD-130 WD-131 1 1 1 1 1 1 1 1 RM171 h IIIh-L : RM289 1 1 1 1 WD-28 WD-41 WD-45 WD-51 h Ia-H : RM289 (5.3) Anhui RM158 RM535 1 11 11 1 WD-57 WD-58 WD-59 WD-64 WD-69 11 1 1 1 WD-79 WD-80 WD-84 WD-85 WD-88 WD-91 WD-92 h IIh-L : Hainan RM158 (1.4) RM535 (2.9) Anhui RM229 (11.5) RM3 (6.5) WD-17 WD-18 WD-19 WD-21 WD-25 WD-27 WD-31 WD-32 WD-33 WD-36 WD-35 WD-39 WD-42 WD-50 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 RM3 RM229 h Ia-L : RM289 (5.3) Hainan RM289 1 1 1 1 1 WD-8 WD-23 WD-26 WD-39 WD-49 WD-50 h Ih-H : RM560 1 1 1 (7.5) RM560 1 1 1 WD-56 WD-57 WD-67 1 1 1 1 1 1 WD-68 WD-70 WD-72 WD-73 WD-76 WD-77 1 1 1 WD-81 WD-86 WD-87 h IIa-H : Anhui RM560 (7.5) RM12 1 1 1 1 1 WD-61 WD-62 WD-65 WD-71 WD-86 WD-87 WD-93 h IIh-H : Hainan RM12 (12.6) Hainan RM229 (11.5) RM171 (10.6) WD-2 WD-5 WD-10 WD-11 WD-13 WD-16 RM171 1 1 1 RM229 1 WD-17 WD-18 WD-20 WD-21 WD-25 WD-27 1 1 1 1 WD-28 WD-29 WD-30 WD-31 WD-32 WD-33 1 1 WD-34 WD-36 WD-37 WD-38 WD-40 WD-41 1 1 1 1 WD-44 WD-45 WD-46 WD-48 1 1 1 1 WD-7 h Ih-L : Anhui RM535 (2.9) RM535 1 1 1 1 WD-58 WD-59 WD-64 WD-80 WD-84 WD-85 1 WD-88 WD-90 WD-91 WD-92 h IIa-L : RM229 1 1 1 1 (11.5) Molecular Breeding Simultaneous improvement and genetic dissection of grain yield and its related traits in a backbone parent of hybrid rice (Oryza sativa L.) using selective introgression Hongjun Zhang, Hui Wang, Yiliang Qian, Jiafa Xia, Zefu Li, Yingyao Shi, Linghua Zhu, Jauhar Ali, Yongming Gao, and Zhikang Li Correspondence should be addressed to Yongming Gao and Zhikang Li (Institute of Crop Sciences/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 100081 Beijing, China; E-mail: irriygao@126.com and zhkli@yahoo.com.cn or zhkli1953@126.com; Tel: +86- 10-8210-6697 and Fax: +86-10-8210-8559)irriygao@126.comzhkli@yahoo.com.cnzhkli1953@126.com