1. Д.А. Равчеев (14 апреля 2009 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Трансмембранные белки

2. АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор

3. Объекты

4.  -баррель  -спирали

5. http://www.tcdb.org/index.php

6. V.W.X.Y.Z

7. В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков — белки с хотя бы одной трансмембранной спиралью Всего  34 000 белковых структур. Мембранных — 191 (0.6% )

8. В чем проблема?

10. von Heijne “the positive-inside rule”

11. http://opm.phar.umich.edu/

12. К ак оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?

13. Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она потверждается. Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не потверждается. Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.