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Diphtheria toxin deconstruction Motivos: módulos simples de combinaciones de estructura secundaria ( a veces se asocian a una función) Dominios: agrupación.

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3 Diphtheria toxin deconstruction

4 Motivos: módulos simples de combinaciones de estructura secundaria ( a veces se asocian a una función) Dominios: agrupación de motivos de plegado característico (pueden o no ser unidades de plegado autónomo; pueden o no estar asociados a una función) Estructura terciaria: combinación de dominios

5 Tipos de dominios alfa beta alfa+beta alfa/beta

6 Motivo: alfa-loop-alfa

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9 Figure 17: The complexation of calcium in EF hands

10 Conservation of calcium binding loop in EF-hand motifs

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12 Figure 24: Effects of calcium binding of the structure of the EF-hand domain of spectrin

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14 CRO repressor Motivo: alfa-turn-alfa

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18 trp repressor

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20 Leucin_rich repeat

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24 Human growth hormone Dominio manojo de hélices

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26 Dominio globina

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28 myoglobin Dominio globina

29 Motivo beta hairpin

30 streptococcal protein G

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37 HLA DQ, una molécula del MHC

38 Porine

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56 Motivo beta-alfa-beta

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59 TIM barrel:closed Rosmann fold

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61 fosforibosil antranilato isomerasa +indol glicerol fosfato sintasa

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65 Flavodoxina: open Rossman fold

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67 Class Number of foldsNumber of superfamiliesNumber of families All alpha proteins All beta proteins Alpha and beta proteins (a/b) Alpha and beta proteins (a+b) Multi-domain proteins40 55 Membrane and cell surface proteins Small proteins Total SCOP: Structural Classification of Proteins release PDB Entries (15 May 2004) Domains. 1 Literature Reference (excluding nucleic acids and theoretical models)

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71 Thanks Alberto Podjarny Ermacora


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