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Université d’Ottawa - Bio 4518 - Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay 2014-08-25 21:07 Traitement du cancer du sein Incidence croissante.

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1 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 Traitement du cancer du sein Incidence croissante (1/8 des femmes en Amérique du Nord) 4 groupes de souris immunodéficientes, injection cellules cancéreuses (C = témoin, X =capecitabine (Xeloda); T = docetaxel (Taxotere) et V = vinorelbine). Mesure volume total des tumeurs après 3 semaines de traitement

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3 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 Short Output: Call: aov(formula = vol ~ traitement, data = cancer, na.action = na.exclude) Terms: traitement Residuals Sum of Squares Deg. of Freedom 3 70 Residual standard error: Estimated effects may be unbalanced Df Sum of Sq Mean Sq F Value Pr(F) traitement Residuals

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6 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 One sample Kolmogorov-Smirnov Test of Composite Normality data: residuals in cancer ks = , p-value = alternative hypothesis: True cdf is not the normal distn. with estimated parameters sample estimates: mean of x standard deviation of x e

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8 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 Call: aov(formula = logvol ~ traitement, data = cancer, na.action = na.exclude) Terms: traitement Residuals Sum of Squares Deg. of Freedom 3 70 Residual standard error: Estimated effects may be unbalanced Df Sum of Sq Mean Sq F Value Pr(F) traitement Residuals

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10 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 One sample Kolmogorov-Smirnov Test of Composite Normality data: residuals in cancer ks = , p-value = alternative hypothesis: True cdf is not the normal distn. with estimated parameters sample estimates: mean of x standard deviation of x e

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12 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 Call: aov(formula = absdif ~ traitement, data = cancer, weights = absdif, na.action = na.exclude) Terms: traitement Residuals Sum of Squares Deg. of Freedom 3 70 Residual standard error: Estimated effects may be unbalanced Df Sum of Sq Mean Sq F Value Pr(F) traitement e-008 Residuals

13 Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :07 Kruskal-Wallis rank sum test data: vol and traitement from data set cancer Kruskal-Wallis chi-square = , df = 3, p-value = alternative hypothesis: two.sided


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